26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3232 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  100 
 
 		 681 aa  1392    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  31.14 
 
 		 689 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  28.01 
 
 		 655 aa  259  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  28.22 
 
 		 676 aa  253  9.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  28.33 
 
 		 671 aa  203  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  26.71 
 
 		 624 aa  191  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  25.46 
 
 		 693 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  25.19 
 
 		 543 aa  158  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  25.46 
 
 		 693 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  25.46 
 
 		 693 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  26.76 
 
 		 667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  30.62 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  29.31 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  27.13 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  23.08 
 
 		 715 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  21.81 
 
 		 745 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  29.06 
 
 		 774 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  29.84 
 
 		 767 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  29.84 
 
 		 767 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  29.63 
 
 		 774 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0309  hypothetical protein  29.17 
 
 		 898 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  24.12 
 
 		 734 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  21.83 
 
 		 779 aa  54.7  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1367  hypothetical protein  20.13 
 
 		 781 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  23.53 
 
 		 751 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  24.46 
 
 		 637 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>