17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2308 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1493    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  28.03 
 
 		 693 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  28.03 
 
 		 693 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  28.03 
 
 		 693 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  24.71 
 
 		 676 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  24.23 
 
 		 655 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  24.36 
 
 		 689 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  24.17 
 
 		 745 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  23.06 
 
 		 681 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  26.96 
 
 		 561 aa  87.4  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  21.57 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  23.63 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  21.99 
 
 		 543 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  21.75 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  22.2 
 
 		 552 aa  52.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  21.93 
 
 		 734 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  19.57 
 
 		 751 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>