21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2900 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  100 
 
 
624 aa  1303    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  46.24 
 
 
561 aa  554  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  37.14 
 
 
676 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  32.33 
 
 
655 aa  323  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  29.26 
 
 
689 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  43.38 
 
 
543 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  42.81 
 
 
539 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  30.44 
 
 
552 aa  191  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  26.62 
 
 
681 aa  187  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  26.05 
 
 
693 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  26.05 
 
 
693 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  26.05 
 
 
693 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  25.33 
 
 
745 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  22.49 
 
 
671 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  21.57 
 
 
715 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  22.2 
 
 
751 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  19.83 
 
 
667 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  22.92 
 
 
767 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  24.81 
 
 
774 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  22.92 
 
 
767 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  22.58 
 
 
774 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.920553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>