18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5178 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  58.74 
 
 		 767 aa  918    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  77.65 
 
 		 774 aa  1254    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  58.74 
 
 		 767 aa  918    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  100 
 
 		 774 aa  1595    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  29.65 
 
 		 681 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  26.98 
 
 		 667 aa  73.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  26.32 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0309  hypothetical protein  28.22 
 
 		 898 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  23.55 
 
 		 671 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  23.83 
 
 		 676 aa  55.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  26.12 
 
 		 689 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  24.81 
 
 		 624 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  25.99 
 
 		 745 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  23.73 
 
 		 561 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  23.14 
 
 		 693 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  23.14 
 
 		 693 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  23.14 
 
 		 693 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  26.07 
 
 		 498 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>