18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4985 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  58.02 
 
 		 767 aa  900    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  100 
 
 		 774 aa  1587    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  58.02 
 
 		 767 aa  900    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  77.65 
 
 		 774 aa  1254    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  29.06 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  26.7 
 
 		 667 aa  73.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0309  hypothetical protein  27.15 
 
 		 898 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  23.82 
 
 		 655 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  25.79 
 
 		 671 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  23.08 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  24.15 
 
 		 561 aa  54.7  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  27.98 
 
 		 689 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  22.76 
 
 		 693 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  22.76 
 
 		 693 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  22.76 
 
 		 693 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  22.58 
 
 		 624 aa  45.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  24.19 
 
 		 498 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1367  hypothetical protein  23.42 
 
 		 781 aa  44.3  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>