17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1845 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  100 
 
 		 767 aa  1570    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  58.02 
 
 		 774 aa  900    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  58.74 
 
 		 774 aa  918    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  100 
 
 		 767 aa  1570    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  29.84 
 
 		 681 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  28.02 
 
 		 667 aa  71.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0309  hypothetical protein  29.38 
 
 		 898 aa  61.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  27.4 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  25.88 
 
 		 693 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  25.88 
 
 		 693 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  25.88 
 
 		 693 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  22.92 
 
 		 624 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  24.57 
 
 		 655 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  23.9 
 
 		 671 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  27.91 
 
 		 561 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  23.16 
 
 		 676 aa  52.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  24.16 
 
 		 745 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>