21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2291 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  100 
 
 		 671 aa  1391    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  27.79 
 
 		 689 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  28.33 
 
 		 681 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  26.27 
 
 		 655 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  24.22 
 
 		 676 aa  161  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  26.39 
 
 		 667 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  22.49 
 
 		 624 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  23.17 
 
 		 693 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  23.17 
 
 		 693 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  23.17 
 
 		 693 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  22.6 
 
 		 561 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  21.61 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  23.29 
 
 		 552 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  25.85 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  21.75 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  25.79 
 
 		 774 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  26.86 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  23.55 
 
 		 774 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  23.9 
 
 		 767 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  23.9 
 
 		 767 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  21.68 
 
 		 734 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>