16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2177 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 734 aa  1539    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  28.62 
 
 		 751 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  24.73 
 
 		 779 aa  218  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  23.71 
 
 		 676 aa  61.2  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  23.79 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  23.79 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  23.79 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  24.12 
 
 		 681 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0309  hypothetical protein  28.25 
 
 		 898 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  20.39 
 
 		 655 aa  52  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  24.59 
 
 		 543 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  21.41 
 
 		 671 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  24.66 
 
 		 689 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  24.68 
 
 		 715 aa  48.1  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  23.44 
 
 		 745 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  25.4 
 
 		 539 aa  45.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>