16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2949 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1133    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  29.34 
 
 		 676 aa  206  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  30.44 
 
 		 624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  31.6 
 
 		 561 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  31.67 
 
 		 539 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  31.21 
 
 		 655 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  30.67 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  28.18 
 
 		 689 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  29.31 
 
 		 681 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  22.66 
 
 		 745 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  23.29 
 
 		 671 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  22.71 
 
 		 667 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  22.2 
 
 		 715 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>