18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3891 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  73.66 
 
 		 539 aa  833    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  100 
 
 		 543 aa  1122    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  30.46 
 
 		 676 aa  286  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  30.25 
 
 		 655 aa  279  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  43.38 
 
 		 624 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  24.6 
 
 		 689 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  30.67 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  25.6 
 
 		 681 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  25.57 
 
 		 745 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  24.34 
 
 		 693 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  24.34 
 
 		 693 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  24.34 
 
 		 693 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  21.99 
 
 		 715 aa  70.5  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  18.96 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  26.86 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  24.59 
 
 		 734 aa  52  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  25.97 
 
 		 751 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>