23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0559 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 693 aa  1453    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  100 
 
 		 693 aa  1453    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 693 aa  1453    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  28.03 
 
 		 715 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  27.17 
 
 		 676 aa  227  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  26.42 
 
 		 655 aa  218  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  26.05 
 
 		 624 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  25.46 
 
 		 681 aa  154  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  24.36 
 
 		 561 aa  151  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  24.14 
 
 		 745 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  23.17 
 
 		 671 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  24.34 
 
 		 543 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  35.42 
 
 		 539 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  26.34 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  23.79 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  25.88 
 
 		 767 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  25.88 
 
 		 767 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  21.95 
 
 		 667 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  22.45 
 
 		 779 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  23.14 
 
 		 774 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  22.76 
 
 		 774 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>