23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4605 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  100 
 
 		 745 aa  1552    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  24.93 
 
 		 676 aa  197  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  25.24 
 
 		 655 aa  187  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  26.12 
 
 		 689 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  25.33 
 
 		 624 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  24.14 
 
 		 693 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  24.14 
 
 		 693 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  24.14 
 
 		 693 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  24.17 
 
 		 715 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  25.57 
 
 		 543 aa  97.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  27.36 
 
 		 561 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  23.47 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  23.29 
 
 		 681 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  22.66 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  22.08 
 
 		 779 aa  63.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  24.11 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  25.85 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  28.32 
 
 		 667 aa  57.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  25.99 
 
 		 774 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  23.44 
 
 		 734 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  26.74 
 
 		 498 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  24.16 
 
 		 767 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  24.16 
 
 		 767 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>