More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1149 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1149  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
403 aa  835    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.215921  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1848  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.25 
 
 
415 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.487586  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.8 
 
 
427 aa  323  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.98 
 
 
425 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.48 
 
 
424 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.33 
 
 
426 aa  296  6e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.02 
 
 
426 aa  295  8e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.13 
 
 
425 aa  295  9e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.78 
 
 
426 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.78 
 
 
426 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.85 
 
 
435 aa  290  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.09 
 
 
436 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.44 
 
 
424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.29 
 
 
426 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 
431 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.16 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.59 
 
 
426 aa  282  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.9 
 
 
442 aa  280  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.41 
 
 
450 aa  279  6e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.49 
 
 
428 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 
431 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.7 
 
 
435 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.23 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.23 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  42.05 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.71 
 
 
435 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.79 
 
 
435 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.05 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.54 
 
 
437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.06 
 
 
437 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.47 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.93 
 
 
429 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.52 
 
 
432 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.05 
 
 
436 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.2 
 
 
435 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.64 
 
 
435 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.52 
 
 
426 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.91 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.72 
 
 
429 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.9 
 
 
449 aa  269  8e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.5 
 
 
435 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.39 
 
 
435 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.02 
 
 
432 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.76 
 
 
436 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.93 
 
 
453 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.75 
 
 
481 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.29 
 
 
432 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.64 
 
 
426 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.16 
 
 
453 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.72 
 
 
463 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.78 
 
 
436 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.72 
 
 
463 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.72 
 
 
463 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.79 
 
 
457 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.63 
 
 
458 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.01 
 
 
460 aa  256  4e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.63 
 
 
460 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.63 
 
 
460 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.86 
 
 
431 aa  256  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.28 
 
 
428 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.16 
 
 
468 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.67 
 
 
432 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.12 
 
 
427 aa  255  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.96 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.73 
 
 
443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.39 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.52 
 
 
432 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.86 
 
 
432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.78 
 
 
457 aa  252  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.91 
 
 
431 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.2 
 
 
430 aa  252  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.11 
 
 
425 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.4 
 
 
459 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.18 
 
 
456 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.34 
 
 
417 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.18 
 
 
456 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.69 
 
 
434 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.56 
 
 
424 aa  249  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.67 
 
 
420 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.93 
 
 
456 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.45 
 
 
430 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.43 
 
 
456 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.93 
 
 
456 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.44 
 
 
617 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.16 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1680  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.84 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.72 
 
 
441 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.67 
 
 
425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  34.67 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  34.66 
 
 
466 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.7 
 
 
426 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  34.66 
 
 
466 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.96 
 
 
489 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  34.92 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.19 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.43 
 
 
466 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.67 
 
 
475 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.5 
 
 
480 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  37.03 
 
 
629 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.64 
 
 
436 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>