More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0188 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1234    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  50.17 
 
 		 608 aa  567  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  34.04 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.62 
 
 		 579 aa  319  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.22 
 
 		 579 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.22 
 
 		 1201 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.94 
 
 		 574 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  37.02 
 
 		 1179 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  35.85 
 
 		 580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.51 
 
 		 590 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  35.75 
 
 		 1179 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.75 
 
 		 1179 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.54 
 
 		 1179 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  32.37 
 
 		 588 aa  310  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  33.67 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  35.7 
 
 		 575 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.42 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 575 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  31.76 
 
 		 1205 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.44 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.97 
 
 		 575 aa  297  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  29.44 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0272  ABC transporter related  30.02 
 
 		 578 aa  289  9e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.933843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  37.58 
 
 		 550 aa  286  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.96 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  32.93 
 
 		 580 aa  282  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1455  ABC transporter related  31.73 
 
 		 583 aa  279  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.490863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  31.88 
 
 		 552 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 611 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  36.44 
 
 		 611 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  34.43 
 
 		 585 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  33.65 
 
 		 595 aa  276  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  34.89 
 
 		 611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.95 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.95 
 
 		 585 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.85 
 
 		 600 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  34.46 
 
 		 579 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  32.88 
 
 		 607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.23 
 
 		 611 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  33.87 
 
 		 601 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  32.75 
 
 		 588 aa  270  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.09 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  34.9 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  34.76 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  32.27 
 
 		 617 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33.79 
 
 		 601 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  33.79 
 
 		 601 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  34.69 
 
 		 606 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  35.29 
 
 		 920 aa  266  7e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.88 
 
 		 600 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  33.66 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.43 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  32.03 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.69 
 
 		 591 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.02 
 
 		 597 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.92 
 
 		 622 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.01 
 
 		 639 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  33.74 
 
 		 579 aa  263  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.8 
 
 		 625 aa  263  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.57 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  32.67 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.22 
 
 		 582 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  34.66 
 
 		 582 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  32.62 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.22 
 
 		 622 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  32.22 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  33.78 
 
 		 603 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.9 
 
 		 605 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.66 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  32.18 
 
 		 637 aa  262  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.08 
 
 		 641 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.96 
 
 		 618 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  33.57 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  38.05 
 
 		 626 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.3 
 
 		 586 aa  261  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  32.76 
 
 		 621 aa  261  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 618 aa  261  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  32.68 
 
 		 567 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.88 
 
 		 583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  33.57 
 
 		 582 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  31.41 
 
 		 592 aa  260  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.76 
 
 		 618 aa  260  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  32.11 
 
 		 672 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.19 
 
 		 585 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  33.33 
 
 		 565 aa  259  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.28 
 
 		 567 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.46 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.08 
 
 		 634 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.5 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  33.1 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.17 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  33.74 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  32.7 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.56 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  37.63 
 
 		 651 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  32.01 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.13 
 
 		 602 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  34.69 
 
 		 632 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>