More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4767 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198401  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
263 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0113  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.04 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0116  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.04 
 
 
268 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.22 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699599  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
272 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0325  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
243 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0711669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  34.82 
 
 
258 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1067  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71076  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
243 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
248 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  36.11 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
251 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
247 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
240 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0328303  normal  0.0791888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
247 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
268 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
264 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145907  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
238 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0621  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
263 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
233 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1784  putative oxidoreductase  36.98 
 
 
256 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
254 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1195  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
239 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
262 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
244 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0960196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
233 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
251 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.347308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2462  short-chain dehydrogenase  30.92 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
265 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3543  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
259 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
251 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  decreased coverage  0.00119468 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
242 aa  102  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
258 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0956  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
290 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
273 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
248 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
312 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
244 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
250 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000715788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68040  putative short-chain dehydrogenase  33.33 
 
 
245 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.915385  normal  0.0126935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
249 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  0.922727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  0.0162871 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
242 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5888  putative short-chain dehydrogenase  32.53 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1415  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.3 
 
 
248 aa  98.6  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.949681  normal  0.622645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1204  Short-chain dehydrogenase/reductase  31.33 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3821  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
244 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1924  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00155305  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4082  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000603  putative 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  32.78 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0031423  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
306 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.487588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449608  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318564  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
268 aa  95.9  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
516 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  31.1 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06461  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  31.95 
 
 
239 aa  95.1  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  34.92 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.96 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>