More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4786 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318564  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.86 
 
 
261 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
266 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
268 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
291 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  40.15 
 
 
258 aa  178  9e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
256 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
260 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
254 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
250 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.25 
 
 
250 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.86 
 
 
257 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 
253 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
260 aa  158  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
255 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
247 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.76 
 
 
246 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.76 
 
 
246 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
254 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
249 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
255 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 
254 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  41.43 
 
 
251 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
255 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
249 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
256 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
248 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1040  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 
253 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.34 
 
 
252 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.94 
 
 
254 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
246 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
249 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
251 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
250 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
270 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
252 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
277 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
248 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
251 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
249 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
255 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
248 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
254 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
254 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
250 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
269 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
266 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
252 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
257 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
257 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  40 
 
 
251 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 
249 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
249 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
243 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
265 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
256 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
253 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
254 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  39.45 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
248 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
263 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0053445  hitchhiker  0.00000000168997 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
256 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.17 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
260 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
255 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.15 
 
 
286 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  36.58 
 
 
260 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4006  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  39.69 
 
 
252 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
257 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
272 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
271 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
244 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
250 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
264 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
254 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
262 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
249 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  35.41 
 
 
256 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
246 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
251 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  33.98 
 
 
247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>