More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4696 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  100 
 
 		 326 aa  634    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  89.49 
 
 		 326 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  82.52 
 
 		 326 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  82.52 
 
 		 326 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1395  GTPase EngC  81.29 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.50736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13257  hypothetical protein  81.99 
 
 		 330 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3589  GTPase EngC  70.86 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1096  GTPase EngC  73.68 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  63.35 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6297  GTPase EngC  64.61 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.928344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5193  ribosome small subunit-dependent GTPase A  57.23 
 
 		 339 aa  342  7e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1383  GTPase EngC  53.87 
 
 		 343 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0287781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2928  ribosome small subunit-dependent GTPase A  55.79 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  54.41 
 
 		 349 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8329  GTPase-like protein  51.16 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1208  GTPase EngC  56.46 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3772  GTPase EngC  57.28 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.069208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0543  hypothetical protein  51.73 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3783  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.35 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07680  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.47 
 
 		 366 aa  298  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0723849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18990  predicted GTPase  58.78 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1206  GTPase EngC  52.99 
 
 		 361 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  51.96 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0534  GTPase EngC  53.82 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3719  GTPase EngC  54.19 
 
 		 374 aa  291  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.39 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.574399  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2654  GTPase EngC  49.15 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00449365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4196  ribosome small subunit-dependent GTPase A  54.21 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2387  GTPase EngC  49.15 
 
 		 371 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000087211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1813  GTPase EngC  52.8 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19480  predicted GTPase  50.43 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3715  GTPase EngC  52.13 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4100  GTPase EngC  53.23 
 
 		 334 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1262  GTPase EngC  53.94 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2495  GTPase EngC  49.73 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.630842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1699  GTPase EngC  51.13 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  38.5 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.81 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  39.83 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32.22 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  39.42 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  38.14 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  39 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.02 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.14 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.65 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  37.59 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.19 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  35.46 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.51 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.3 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  37.08 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.22 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1014  ribosome-associated GTPase  36.53 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.45 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.51 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  31.25 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.89 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.89 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.89 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  34.55 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2970  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359384  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  36.49 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.74 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  36.76 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.28 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.07 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.07 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.07 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.37 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.88 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.07 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  34.1 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  32.38 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  32.74 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  32.74 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  33.04 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  29.23 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  34.54 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.27 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  31.98 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>