More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0385 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0385  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
261 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191338  normal  0.50714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0817  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0821  diguanylate phosphodiesterase  33.06 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0769  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.6716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2600  EAL domain-containing protein  28.45 
 
 
244 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.998964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2038  diguanylate phosphodiesterase  31.44 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0902061  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34930  EAL domain protein, diguanylate phosphodiesterase  30.04 
 
 
244 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1896  putative diguanylate phosphodiesterase  28.38 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.492232  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4256  diguanylate phosphodiesterase  30.38 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2051  EAL domain protein  27.51 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.235592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1592  EAL domain-containing protein  27.73 
 
 
244 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000336916  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1862  diguanylate phosphodiesterase  24.66 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2039  hypothetical protein  25.35 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2112  diguanylate phosphodiesterase  24.66 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.338505  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2286  diguanylate phosphodiesterase  22.73 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0551035  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2237  diguanylate phosphodiesterase  24.77 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162891  normal  0.294289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2622  diguanylate phosphodiesterase  27.63 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271665  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2274  diguanylate phosphodiesterase  23.85 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4560  hypothetical protein  23.85 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2052  diguanylate phosphodiesterase  22.27 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2099  diguanylate phosphodiesterase  22.27 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.611032  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2106  diguanylate phosphodiesterase  24.09 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1659  diguanylate phosphodiesterase  23.95 
 
 
540 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.308639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1968  diguanylate phosphodiesterase  23.98 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0227  diguanylate phosphodiesterase  22.36 
 
 
429 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.28 
 
 
806 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0807  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.89 
 
 
803 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  25.79 
 
 
357 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  22.55 
 
 
356 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1542  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.02 
 
 
1006 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0071  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.45 
 
 
697 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  26.11 
 
 
427 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  25.73 
 
 
367 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0220  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  21.72 
 
 
598 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  26.11 
 
 
403 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  26.11 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1912  diguanylate phosphodiesterase  21.74 
 
 
554 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  23.01 
 
 
454 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2658  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.7 
 
 
641 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  23.14 
 
 
500 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  26.11 
 
 
474 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  26.11 
 
 
474 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  26.11 
 
 
482 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  22.71 
 
 
706 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2763  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.48 
 
 
820 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.11 
 
 
657 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293747  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  21.27 
 
 
598 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1391  diguanylate phosphodiesterase  28.14 
 
 
534 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16215  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.6 
 
 
616 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  21.74 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2398  periplasmic sensor diguanylate phophodiesterase  22.42 
 
 
506 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625554  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1469  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.02 
 
 
806 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0948188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0238  GGDEF/EAL domain-containing protein  22.73 
 
 
775 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000652634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2589  hypothetical protein  24.43 
 
 
759 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394973  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1154  hypothetical protein  24.3 
 
 
603 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0954  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.72 
 
 
657 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552407  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.81 
 
 
616 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5381  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  23.68 
 
 
604 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.788293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.11 
 
 
736 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1982  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.19 
 
 
676 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0102834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.12 
 
 
743 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0235  GGDEF/EAL domain-containing protein  21.97 
 
 
775 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0547392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  22.05 
 
 
371 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.96 
 
 
551 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  21.46 
 
 
734 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0006  EAL domain protein  21.25 
 
 
471 aa  52.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0317  GGDEF family protein  26.24 
 
 
481 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.7 
 
 
633 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  22.91 
 
 
283 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.25 
 
 
599 aa  52  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.88 
 
 
786 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1743  sensory box protein  20.23 
 
 
719 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1405  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20 
 
 
1122 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000520478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1183  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.88 
 
 
722 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.18 
 
 
753 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05168  cellobiose-specific phosphotransferase system enzyme IIC  23.26 
 
 
661 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  22.91 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  22.27 
 
 
538 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.58 
 
 
706 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.34 
 
 
569 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0553  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.76 
 
 
699 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1906  diguanylate phosphodiesterase  23.11 
 
 
410 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  19.64 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0207  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.22 
 
 
536 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155784  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3335  EAL domain protein  22.03 
 
 
540 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  23.53 
 
 
858 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  24.49 
 
 
743 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0875  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.34 
 
 
578 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1611  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  21.72 
 
 
946 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.319418  normal  0.0964053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  20.59 
 
 
409 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1243  diguanylate phosphodiesterase  20.8 
 
 
508 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  20.34 
 
 
734 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3329  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.48 
 
 
684 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.03 
 
 
917 aa  49.7  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  22.47 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  23.66 
 
 
563 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3139  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.44 
 
 
764 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.423173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1149  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.87 
 
 
730 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  20.16 
 
 
351 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  25.32 
 
 
427 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>