206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1765 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  99.3 
 
 		 287 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  97.21 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  79.09 
 
 		 287 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  66.55 
 
 		 279 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  66.55 
 
 		 279 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  46.74 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0828  UspA domain protein  44.1 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0482749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  37.86 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  44.13 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  34.12 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  30.43 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  37.28 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  38.97 
 
 		 271 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.15 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.62 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  31.13 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  44.94 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.79 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.79 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.79 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.79 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.79 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.79 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37.06 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  36.65 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  34.34 
 
 		 280 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  41.57 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  31.35 
 
 		 277 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 271 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  38.2 
 
 		 280 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 270 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  33.04 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  33.71 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  37.23 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 272 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  33.51 
 
 		 272 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 271 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  35.26 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  29.63 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  37.44 
 
 		 277 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  44.59 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  36.1 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  35.33 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  35.96 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  32.44 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.12 
 
 		 277 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  38.16 
 
 		 281 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  33.18 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  32.8 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  38.16 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.43 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  36.32 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.76 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.76 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0238  universal stress protein  26.44 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 279 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  30.48 
 
 		 277 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  36.18 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  35.08 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  36.8 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 268 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  29.39 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  36.49 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  30.72 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  36.18 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.29 
 
 		 274 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.32 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  38.67 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.32 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.06 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.32 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.32 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  34.54 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.44 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  34.62 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  35.98 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  31.21 
 
 		 278 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  28.82 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  29.68 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  36.36 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  29.83 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  34.07 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  41.14 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  40.27 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  36.61 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  29.8 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>