296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4594 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  52.86 
 
 		 709 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  53.3 
 
 		 708 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  49.28 
 
 		 714 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  52.37 
 
 		 703 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  51.72 
 
 		 703 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  60 
 
 		 706 aa  829    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  49.58 
 
 		 713 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  62.84 
 
 		 717 aa  862    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  100 
 
 		 696 aa  1412    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  50.64 
 
 		 714 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  58.96 
 
 		 711 aa  819    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  48.89 
 
 		 714 aa  631  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  50.22 
 
 		 687 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  49.64 
 
 		 712 aa  626  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  50.67 
 
 		 687 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  48.46 
 
 		 713 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  51.06 
 
 		 687 aa  618  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  50.91 
 
 		 703 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  48.28 
 
 		 734 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  46.66 
 
 		 708 aa  608  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  47.11 
 
 		 706 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  47.11 
 
 		 706 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  48.99 
 
 		 709 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  48.34 
 
 		 685 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  47.65 
 
 		 694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  45.1 
 
 		 717 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  46.68 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  45.26 
 
 		 759 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  43.19 
 
 		 716 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  47.94 
 
 		 577 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  41.3 
 
 		 723 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  42.24 
 
 		 726 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  46.64 
 
 		 577 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  46.52 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  42.63 
 
 		 715 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  47.22 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  41.5 
 
 		 694 aa  436  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  42.68 
 
 		 582 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  42.74 
 
 		 528 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  35.34 
 
 		 636 aa  330  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  36.16 
 
 		 615 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  36.18 
 
 		 654 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  32.98 
 
 		 658 aa  294  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 645 aa  281  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  33.88 
 
 		 688 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  33.88 
 
 		 688 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.12 
 
 		 682 aa  270  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  33.97 
 
 		 683 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  34.67 
 
 		 709 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  34.01 
 
 		 681 aa  260  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.15 
 
 		 683 aa  260  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  33.82 
 
 		 687 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  33.89 
 
 		 690 aa  254  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  31 
 
 		 751 aa  253  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  32.88 
 
 		 684 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  33.69 
 
 		 679 aa  251  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  32.93 
 
 		 684 aa  251  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  31.8 
 
 		 667 aa  247  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  33.49 
 
 		 677 aa  244  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  33.79 
 
 		 687 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  33.23 
 
 		 680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  33.23 
 
 		 689 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  32.32 
 
 		 765 aa  238  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  33.85 
 
 		 679 aa  232  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  31.52 
 
 		 740 aa  227  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.27 
 
 		 623 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.89 
 
 		 690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  32.98 
 
 		 754 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  32.52 
 
 		 692 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.97 
 
 		 662 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.87 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  42.34 
 
 		 369 aa  205  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  30.63 
 
 		 727 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  69.74 
 
 		 172 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  59.62 
 
 		 156 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  27.85 
 
 		 669 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  28.27 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  28.27 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  28.27 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  27.04 
 
 		 624 aa  160  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.39 
 
 		 624 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  28.82 
 
 		 624 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  26.5 
 
 		 729 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  28.59 
 
 		 624 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  63.2 
 
 		 133 aa  152  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  25.83 
 
 		 652 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  25.87 
 
 		 654 aa  146  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  25.87 
 
 		 652 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  25.57 
 
 		 654 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  62.6 
 
 		 129 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  60.16 
 
 		 129 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  28.62 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  39.37 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  36.21 
 
 		 380 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  25.44 
 
 		 670 aa  125  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  30.86 
 
 		 623 aa  124  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  29.43 
 
 		 660 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  51.61 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  32.15 
 
 		 603 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  32.13 
 
 		 603 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>