More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4495 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.51 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.02 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  54.95 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  47.99 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  54.21 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  45.85 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  44.7 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  46.53 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  45.92 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  44.33 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.34 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  52.76 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  43.64 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.64 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  38.1 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.83 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.41 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.5 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  39.13 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  36.42 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  36.61 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  36.42 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.42 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.42 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  37.92 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  54 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.1 
 
 		 322 aa  175  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  36.09 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.74 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.09 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.09 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  36.09 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  38.72 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.09 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.51 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  35.91 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  36.72 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  34.46 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  37.22 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.22 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.22 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  33.89 
 
 		 318 aa  168  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  35.57 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.49 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  38.24 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.11 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.45 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.41 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.63 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.67 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  39.34 
 
 		 258 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  32.91 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.35 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  36.91 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  36.03 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.37 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  35.48 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  34.56 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  34.56 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  33.71 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  34.94 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  34.54 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.45 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  32.55 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  34.11 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.84 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  34.11 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.76 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  34.98 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.78 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  33.66 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.68 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  34.8 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.24 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  33.21 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  32.67 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  32.21 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  32.67 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.32 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  32.67 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.32 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.66 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 330 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.01 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.41 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.21 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  30.87 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.56 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>