More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3862 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3862  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 341 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1471  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3989  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119211  normal  0.0654574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0606  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2313  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0498  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0738  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0804  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3703  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 295 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1510  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 276 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0433683  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  32.17 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  29.51 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  29.51 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 299 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 299 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.17 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  29.17 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.17 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0307  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7451  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193814  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0946  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0956  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1002  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.69 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4632  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3128  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 302 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  23.84 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.86 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1196  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1681  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.439861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1712  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>