More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1712 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1712  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7451  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193814  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1002  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0307  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3703  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0738  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3862  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1510  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0433683  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  28.52 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.48 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0606  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  26.13 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0956  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3989  LysR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119211  normal  0.0654574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  27.78 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  25.43 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1471  LysR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  26.6 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1340  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.86 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  27.46 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  27.92 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6203  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.28 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.28 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.28 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  28.28 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>