More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6203 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6203  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  86.82 
 
 
296 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  76.71 
 
 
296 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 
301 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  54.51 
 
 
298 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  54.51 
 
 
298 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  55.17 
 
 
335 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  50.69 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
295 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
299 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
295 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  52.67 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
302 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
302 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
302 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
302 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
302 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  51.23 
 
 
297 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5149  LysR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
300 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  45.17 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2391  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 
297 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0830106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0352  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 
294 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 
299 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
301 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0038  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
294 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5767  LysR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0036  transcriptional regulator, LysR family  40.52 
 
 
306 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  42.34 
 
 
292 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 
306 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
297 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.78 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  39.78 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 
297 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
328 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
328 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
302 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
299 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 
301 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
304 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  35.62 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  35.62 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  42.37 
 
 
331 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  35.62 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
303 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 
299 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 
299 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
298 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
306 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
297 aa  188  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  35.27 
 
 
301 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  35.27 
 
 
301 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  38.35 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  42.37 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.37 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  38.35 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.37 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
304 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  38.35 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
297 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  38.35 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  38.35 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  41.86 
 
 
337 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.37 
 
 
329 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  43.33 
 
 
320 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
298 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
318 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  40.21 
 
 
301 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
305 aa  185  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.28 
 
 
331 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
306 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
306 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 
304 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  41.67 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  41.67 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
297 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 
321 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.01 
 
 
300 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
295 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>