More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3065 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 375 aa  747    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  74.46 
 
 		 378 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  74.46 
 
 		 378 aa  531  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  72.88 
 
 		 378 aa  522  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  71.23 
 
 		 376 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  70.99 
 
 		 376 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  68.77 
 
 		 380 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  68.96 
 
 		 381 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  60.59 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  62.7 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  60.99 
 
 		 594 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  63.19 
 
 		 370 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  62.47 
 
 		 382 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  61.2 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  59.83 
 
 		 593 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  61.43 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  63.33 
 
 		 615 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  63.31 
 
 		 579 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  63.48 
 
 		 579 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  63.48 
 
 		 604 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  61.64 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  58.36 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  60.76 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  61.92 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  61.04 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  61.56 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  57.81 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  57.46 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  58.4 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  55.89 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 370 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  56.71 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  56.2 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  56.99 
 
 		 385 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  53.72 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  53.74 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  53.7 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  52.47 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  50.41 
 
 		 591 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  49.59 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  46.41 
 
 		 364 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  46.41 
 
 		 364 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  45.15 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  50.82 
 
 		 552 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  48.75 
 
 		 359 aa  301  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  46.85 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  46.31 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  47.95 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  46.85 
 
 		 361 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  44.96 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  47.29 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  47.31 
 
 		 366 aa  292  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  45.9 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  48.62 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  44.54 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  47.93 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  47.46 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  47.21 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  46.65 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  47.49 
 
 		 367 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  44.82 
 
 		 359 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  44.48 
 
 		 362 aa  285  9e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  46.45 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  46.18 
 
 		 368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  46.93 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  44.92 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  45.11 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  48.54 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  44.63 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  48.56 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0659  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  48.5 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.89 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  43.56 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  46.37 
 
 		 360 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 366 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 		 366 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.34 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  46.76 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  47.56 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  47.49 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  45.28 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  44.32 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 359 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  43.91 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  42.08 
 
 		 364 aa  277  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>