52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1193 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  100 
 
 		 230 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  48.57 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  58.39 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  36.6 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  40.43 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  40.25 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  30.39 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  33.54 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  36.18 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  36 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4241  hypothetical protein  39.51 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  33.18 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  34.16 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  31.16 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  30.46 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  31.66 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  27.36 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  29.95 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  29 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  28.42 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  29.85 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  27.6 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  27.89 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  29.41 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.49 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  29.35 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  31.49 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  30.77 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  28.72 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  27.4 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  28.18 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  24.76 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.87 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  32.43 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  25.1 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  31.49 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  25.11 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  28.57 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1993  peptidase S24 and S26 domain-containing protein  30.77 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  28.28 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30.2 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  27.93 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  27.17 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  24.03 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  26.64 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 104 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  27.17 
 
 		 208 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>