More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0408 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0408  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.317858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  46.37 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.9 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.63 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  37.79 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  32.18 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.62 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.78 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.3 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.3 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.3 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  32.49 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.3 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.26 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  32.16 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.47 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.72 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  31.14 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  31.45 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.14 
 
 		 279 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  31.42 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.42 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  31.05 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  31.56 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  30.09 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  32.92 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.7 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  32.05 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.87 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>