289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1307 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1307  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.385946  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.5 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.79 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.99 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25.35 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  25.94 
 
 
225 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.15 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.61 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.06 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.36 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.4 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  25.5 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  25.73 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  25.5 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.76 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.83 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2378  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.06 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.06 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
245 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1123  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.26 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.21 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.68 
 
 
225 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1045  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.21 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.19 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  31.67 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.06 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1491  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0202312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1785  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.377507  normal  0.141635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.32 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.63 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
223 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.32 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003475  fumarate and nitrate reduction regulatory protein  24.21 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.292896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.32 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.251439 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1045  Crp-like transcriptional regulator  29.58 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.32 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1845  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.32 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.32 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1673  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349784  normal  0.0983377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.53 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.35 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3712  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.9 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2105  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.96 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0944449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  22.1 
 
 
240 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4190  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2081  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2398  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.96 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.44 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2293  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.8 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.43 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1833  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.8 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.8 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.49 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3233  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.49 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1600  cyclic nucleotide-binding protein  25.35 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  25.37 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  25.3 
 
 
352 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.01 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.29 
 
 
223 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>