More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5669 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 699 aa  1370    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  39.65 
 
 		 720 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  37.36 
 
 		 683 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  38.53 
 
 		 715 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 		 625 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  34.01 
 
 		 590 aa  248  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  40.21 
 
 		 715 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  40.26 
 
 		 715 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  40.78 
 
 		 627 aa  217  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  34.61 
 
 		 619 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  30.9 
 
 		 697 aa  207  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  30.96 
 
 		 704 aa  204  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  33.1 
 
 		 694 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3719  hypothetical protein  38.71 
 
 		 449 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 646 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  31.35 
 
 		 782 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6052  AAA ATPase central domain protein  31.09 
 
 		 634 aa  157  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.248698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2284  putative cell division protein  31.35 
 
 		 634 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0284876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.4 
 
 		 642 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.82 
 
 		 640 aa  156  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.82 
 
 		 640 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  30.28 
 
 		 658 aa  154  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.99 
 
 		 673 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.19 
 
 		 642 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.19 
 
 		 642 aa  154  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.1 
 
 		 639 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.68 
 
 		 610 aa  153  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.18 
 
 		 630 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1916  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.65 
 
 		 598 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  29.48 
 
 		 633 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.71 
 
 		 614 aa  152  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2307  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.16 
 
 		 599 aa  151  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0665193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.18 
 
 		 681 aa  150  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  35.93 
 
 		 663 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5769  ATPase central domain-containing protein  30.79 
 
 		 637 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.94 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  29.67 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  30.61 
 
 		 514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.95 
 
 		 619 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  29.44 
 
 		 784 aa  148  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.77 
 
 		 640 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.44 
 
 		 618 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.84 
 
 		 616 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.08 
 
 		 637 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  29.67 
 
 		 627 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.89 
 
 		 605 aa  147  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  30.31 
 
 		 800 aa  147  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0297  putative cell division protein  33.04 
 
 		 635 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168134 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  32.2 
 
 		 646 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  33.8 
 
 		 641 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  29.68 
 
 		 605 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.33 
 
 		 760 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.37 
 
 		 643 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.21 
 
 		 682 aa  145  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  27.94 
 
 		 620 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.21 
 
 		 632 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.75 
 
 		 615 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.11 
 
 		 635 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.69 
 
 		 635 aa  144  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.3 
 
 		 611 aa  144  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.48 
 
 		 697 aa  144  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  30 
 
 		 630 aa  144  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.96 
 
 		 812 aa  143  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.96 
 
 		 623 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.21 
 
 		 624 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.11 
 
 		 643 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.93 
 
 		 622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.48 
 
 		 602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  31.32 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.6 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 		 640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  28.67 
 
 		 612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.18 
 
 		 660 aa  142  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.12 
 
 		 655 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 		 638 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.48 
 
 		 621 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.4 
 
 		 607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.23 
 
 		 643 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  30.36 
 
 		 642 aa  141  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  31 
 
 		 623 aa  141  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.19 
 
 		 620 aa  141  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.29 
 
 		 673 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1832  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.54 
 
 		 623 aa  140  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.81 
 
 		 640 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.29 
 
 		 673 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.13 
 
 		 640 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.23 
 
 		 641 aa  140  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.18 
 
 		 610 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  31.29 
 
 		 609 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.13 
 
 		 640 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.27 
 
 		 666 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.41 
 
 		 630 aa  140  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.81 
 
 		 638 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  32.38 
 
 		 659 aa  140  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.59 
 
 		 620 aa  140  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.91 
 
 		 621 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  29.95 
 
 		 652 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  28.82 
 
 		 638 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  28.95 
 
 		 697 aa  140  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.08 
 
 		 666 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>