More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1884 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1884  CBS domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  292  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.37 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  35.25 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.94 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  27.27 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2679  signal-transduction protein  29.92 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.136192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.27 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  27.61 
 
 
295 aa  61.6  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  28.03 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  30.17 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.45 
 
 
586 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.27 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.65 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  28.19 
 
 
233 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.08 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  29.46 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  27.69 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  25.16 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  25.32 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.66 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28 
 
 
230 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
215 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.71 
 
 
600 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  30.08 
 
 
262 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  24.68 
 
 
339 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.14 
 
 
637 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.88 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  25.66 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  26.19 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  26.4 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  24.83 
 
 
249 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  25.78 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 
219 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  33.61 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.25 
 
 
769 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  24.5 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  25.2 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  29.13 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  26 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.33 
 
 
650 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  26.4 
 
 
909 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  26.36 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
279 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  24.6 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 
615 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  27.07 
 
 
186 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  21.48 
 
 
241 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.7 
 
 
636 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  24.46 
 
 
368 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  29.29 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  29.13 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  29.51 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  28.99 
 
 
426 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
200 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  25.17 
 
 
217 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  26.39 
 
 
637 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  25.95 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  27.13 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  26.67 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  25.4 
 
 
625 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  26.97 
 
 
223 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  25.98 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  26.67 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  25.62 
 
 
613 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  26.98 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 
256 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 
313 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  24.34 
 
 
152 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 
279 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  29.41 
 
 
146 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  25.52 
 
 
232 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  32.26 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  23.08 
 
 
382 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  27.64 
 
 
155 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
144 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  22.38 
 
 
382 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  26.32 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  28.12 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.35 
 
 
649 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  25.36 
 
 
216 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
279 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 
688 aa  50.4  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  26.53 
 
 
232 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>