More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2007 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  63.18 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.19 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3894  ABC transporter related  47.96 
 
 		 222 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  48.43 
 
 		 715 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.27 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.91 
 
 		 653 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  45.91 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  47 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.78 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.03 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  45.16 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.86 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  44.84 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  45.91 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  44.75 
 
 		 234 aa  188  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.24 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 253 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.26 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.82 
 
 		 237 aa  188  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.61 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.27 
 
 		 665 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  42.27 
 
 		 665 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  42.73 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  42.73 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  45.98 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.73 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  45.91 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.27 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.25 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  44.55 
 
 		 248 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  43.84 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  43.36 
 
 		 252 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  48.11 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  47.09 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  43.52 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45 
 
 		 642 aa  184  8e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  42.27 
 
 		 647 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.66 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.66 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  47.09 
 
 		 707 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.27 
 
 		 649 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  47.71 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.29 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.62 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  41.59 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  43.81 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.29 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.78 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  45 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  42.73 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.25 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  43.95 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  43.95 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.82 
 
 		 649 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>