More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0222 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  56.76 
 
 		 274 aa  291  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  52.85 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  53.41 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  49.03 
 
 		 259 aa  248  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  43.28 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  44.77 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  43.85 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  42.69 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  45.06 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  43.77 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  45.49 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  46.05 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  40.52 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  43.12 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  47.93 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  41.04 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 263 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 266 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  41.89 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  45.04 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  43.57 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  45.04 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  41.13 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  45.06 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  41.89 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  36.8 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  42.37 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.61 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  43.21 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  41.38 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  43.39 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  40.61 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  43.7 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  43.21 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 279 aa  195  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  43.15 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  44.64 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  43.85 
 
 		 269 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  41.79 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.11 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>