206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0868 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0868  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 388 aa  783    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl681  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.29 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0707  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.28 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf881  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.97 
 
 		 650 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  26.29 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  23.02 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  21.3 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.01 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  24.89 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  23.16 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  25.83 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  25.58 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  25.78 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  25.19 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.77 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  26.6 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.21 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  23.2 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  26.36 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.76 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  27.31 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  25.58 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  25.58 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  25.58 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  25.58 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  25.58 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  26.48 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  25 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  26.85 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.9 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  25.29 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  25.42 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1038  60 kDa inner membrane insertion protein  25.21 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0516206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.26 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.94 
 
 		 579 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  26.37 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  24.73 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  25.12 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  25.82 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  25 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.12 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.12 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.86 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  23.87 
 
 		 566 aa  57  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.74 
 
 		 532 aa  57  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  22.96 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  24.89 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1565  60 kDa inner membrane insertion protein  36.36 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150005  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  23.98 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  24.89 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  23.85 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  23.11 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  24.26 
 
 		 548 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.79 
 
 		 623 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.52 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.79 
 
 		 623 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  21.86 
 
 		 628 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  25.71 
 
 		 541 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  24 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  24.41 
 
 		 605 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  18.49 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  24.78 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  23.77 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.76 
 
 		 610 aa  53.9  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.75 
 
 		 518 aa  53.9  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.76 
 
 		 610 aa  53.9  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.24 
 
 		 606 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46411  predicted protein  26.02 
 
 		 467 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  23.4 
 
 		 624 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3943  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  26.85 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  21.91 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  25.24 
 
 		 541 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  24.92 
 
 		 699 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  25.54 
 
 		 583 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  25.24 
 
 		 541 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.97 
 
 		 531 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.87 
 
 		 548 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.32 
 
 		 548 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  23.43 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  24.43 
 
 		 532 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.24 
 
 		 609 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.32 
 
 		 548 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.71 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  17.34 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.32 
 
 		 548 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  22.5 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.32 
 
 		 548 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.89 
 
 		 530 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  22.5 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.68 
 
 		 526 aa  51.6  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.12 
 
 		 616 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  24.76 
 
 		 541 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  26 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.89 
 
 		 530 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.64 
 
 		 548 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  23.38 
 
 		 225 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  24.76 
 
 		 541 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.22 
 
 		 626 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>