More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2415 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
374 aa  754    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  43.35 
 
 
348 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  39.76 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 
390 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  41.37 
 
 
375 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  39.71 
 
 
346 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  40.21 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
365 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
375 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  40.17 
 
 
399 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
368 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  41.67 
 
 
368 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.53 
 
 
379 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
420 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  40.39 
 
 
419 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 
396 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
361 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
384 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
364 aa  122  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 
359 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.18 
 
 
366 aa  119  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  39.22 
 
 
419 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  45.22 
 
 
374 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.18 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.58 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  40.74 
 
 
393 aa  113  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.89 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  33.17 
 
 
365 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  32.74 
 
 
365 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  31.62 
 
 
365 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
374 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
364 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  38.5 
 
 
399 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
364 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
379 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
359 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
396 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
1032 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
363 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.99 
 
 
374 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
375 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
418 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.44 
 
 
392 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.44 
 
 
392 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.44 
 
 
420 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.44 
 
 
420 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.44 
 
 
420 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.44 
 
 
420 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.44 
 
 
420 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 
364 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  28.2 
 
 
321 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
365 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
376 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
388 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.75 
 
 
365 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
381 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  24.33 
 
 
366 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.12 
 
 
386 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.27 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
425 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
393 aa  95.9  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.99 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  41.04 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
361 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
660 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
361 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>