More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2267 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  59 
 
 		 200 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  53.57 
 
 		 205 aa  197  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  50.25 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  50.51 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  50 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  50 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  50 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  49.49 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  50 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  50 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  50 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  50 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  47.18 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  37.37 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  37.44 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  43.78 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  43.94 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  41.21 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  39.58 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  41.71 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  41.71 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  42.21 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  40.72 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  36.5 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  36.5 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  36.5 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  37.37 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  43.75 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  34.85 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  35.35 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  37.37 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  39.15 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  37.89 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  39.46 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  33.51 
 
 		 223 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  40.54 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  37.24 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  37.57 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  37.24 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  38.02 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  38.62 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  36.9 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  38.74 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  44.53 
 
 		 151 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  37.7 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  36.17 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  35.18 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  37.06 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.63 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  38.17 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  36.57 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  41.75 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  32.43 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  37.63 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  36.36 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  37.43 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.64 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  34.5 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  34.21 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  34.5 
 
 		 321 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  40.13 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  41.8 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  34.38 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  34.38 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  39.23 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  40.21 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  34.9 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  31.02 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  33.15 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  38.33 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.31 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  31.91 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.54 
 
 		 330 aa  85.1  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  31.52 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.21 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.61 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  30.77 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.49 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  32.52 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.68 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.3 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  33.33 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.66 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  27.71 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.95 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.98 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  31.87 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  25.13 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.7 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.55 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  26.88 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  22.84 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>