More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0777 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  49.52 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  45.71 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  47.34 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  46.73 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  37.91 
 
 		 229 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  43.13 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  38.5 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  35.55 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  39.62 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.81 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  36.15 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  35.89 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  37.02 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  36.95 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  36.19 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  36.84 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  35.07 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  36.95 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  36.54 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  37.74 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  36.79 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  34.76 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  34.76 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  34.76 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  35.24 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35.85 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  33.17 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.27 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  33.17 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.96 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  34.31 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  33.65 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  38.39 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>