More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4023 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 352 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3183  glycosyl transferase group 1  86.34 
 
 		 352 aa  564  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  29.35 
 
 		 404 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  20.05 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.38 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.28 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  25.91 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 471 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  26.3 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.02 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  26.92 
 
 		 935 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0274  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  28.88 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  28.06 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.28 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  24.44 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  24.74 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  29.31 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.69 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  27.16 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.49 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  25.61 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.31 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  26.78 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.73 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.29 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 812 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>