More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3183 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3183  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 352 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  86.34 
 
 		 352 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.55 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  27.34 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  26.65 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  27.2 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  21.01 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 476 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.94 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.39 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.92 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 		 536 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.01 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0709  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.6 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.57 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  23.95 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  25.94 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  25.97 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  27.23 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  25.21 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 412 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.54 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.06 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.06 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  28.43 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.06 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  26.5 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.09 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  30.57 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.28 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.18 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.14 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>