More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1908 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 340 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  91.76 
 
 		 340 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  69.71 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  61.7 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  59.87 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  59.87 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  62.01 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  59.25 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  61.02 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  55.52 
 
 		 291 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  54.87 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  48.04 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  40.76 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  40.67 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  40.12 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  40.45 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  41.1 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  37.61 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  56 
 
 		 239 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  34.74 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  61.48 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  53.38 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  34.44 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  53.03 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  51.52 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  60 
 
 		 264 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  55.12 
 
 		 262 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  55.91 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 260 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  43.44 
 
 		 291 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.15 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  43.07 
 
 		 217 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.08 
 
 		 448 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 1160 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  34.16 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 140 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.19 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.68 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  38.19 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  39.37 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  44.25 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 245 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.19 
 
 		 197 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  38.76 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  40.34 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  35.26 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  42.74 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.01 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  45.61 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.77 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  45.92 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  38.92 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  44.55 
 
 		 200 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.02 
 
 		 198 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  38.97 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 238 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  40.87 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  37.69 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  34.19 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  34.64 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  41.44 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  36.67 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  34.19 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2287  phage internal core protein  37.33 
 
 		 1569 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  41.6 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  39.69 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 716 aa  73.9  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  34.19 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.74 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  34.19 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  36.22 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  37.19 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  38.41 
 
 		 643 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>