More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1295 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  85.31 
 
 
406 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  100 
 
 
398 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  48.5 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  45.97 
 
 
410 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  47.61 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  44.89 
 
 
399 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  46.37 
 
 
401 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  42.63 
 
 
388 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 
388 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  42.23 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  44.41 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  45.89 
 
 
427 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  44.85 
 
 
395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  45.43 
 
 
385 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  43.14 
 
 
410 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  46.59 
 
 
400 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  43.5 
 
 
403 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  45.07 
 
 
402 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
390 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 
400 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  46.59 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  44.2 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  42.23 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  41.9 
 
 
402 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  41.9 
 
 
402 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  40.98 
 
 
408 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  42.6 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  42.45 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
395 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  41.21 
 
 
388 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  39.34 
 
 
397 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  40.31 
 
 
393 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  34.84 
 
 
375 aa  232  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  37.36 
 
 
389 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  39.56 
 
 
415 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  38.33 
 
 
379 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  38.98 
 
 
411 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 
398 aa  229  8e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  41.51 
 
 
381 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  34.11 
 
 
385 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.9 
 
 
388 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  33.85 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  34.11 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  35.14 
 
 
392 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 
386 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  36.91 
 
 
396 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 
382 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  33.86 
 
 
387 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.69 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  40 
 
 
393 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  35.32 
 
 
390 aa  222  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  38.1 
 
 
388 aa  222  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  37.95 
 
 
404 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 
405 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
398 aa  222  9e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  36.03 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 
412 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  36.03 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  36.77 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  33.61 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  37.4 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  33.25 
 
 
392 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  33.6 
 
 
401 aa  219  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 
386 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  38.25 
 
 
381 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
393 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  38.08 
 
 
387 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  37.57 
 
 
402 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  35.52 
 
 
399 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  35.87 
 
 
417 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  35.1 
 
 
412 aa  218  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  32.75 
 
 
397 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  38.11 
 
 
460 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  34.27 
 
 
402 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  32.05 
 
 
387 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  32.57 
 
 
392 aa  217  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  35.66 
 
 
409 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  33.05 
 
 
387 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  36.78 
 
 
410 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  35.69 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  36.77 
 
 
388 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  35.39 
 
 
405 aa  216  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  37.72 
 
 
410 aa  215  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  36.05 
 
 
400 aa  215  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  38.67 
 
 
412 aa  215  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  35.01 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  34.47 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  40.64 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>