193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3553 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  66.67 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  68.12 
 
 		 229 aa  287  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  67.11 
 
 		 236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  64.1 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  62.39 
 
 		 228 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.76 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  62.67 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.17 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.96 
 
 		 231 aa  244  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  58.01 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  63.05 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  63.05 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  63.05 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  57.08 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.02 
 
 		 227 aa  241  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.7 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  63.45 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  54.42 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  56.96 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.85 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.41 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  56.33 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  60.89 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  59.13 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  58.3 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.51 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  58.74 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  58.14 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.71 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  57.08 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  55.07 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  57.62 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  54.15 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  46.34 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  42.74 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.01 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.01 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.99 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  33.5 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  34.35 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  30.88 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  32.04 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.2 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.53 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.5 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.09 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.89 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.97 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.97 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  33.72 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.9 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  30.94 
 
 		 218 aa  89  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.22 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  34.15 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  38.81 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  32.56 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  38.85 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  35.48 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.25 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.25 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  29.9 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  38.64 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  33.73 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.55 
 
 		 214 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  33.04 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.36 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.23 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.97 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  30.87 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.95 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34.59 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34.59 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34.59 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.12 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2442  Iron dependent repressor:FeoA  30.41 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.681497  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.23 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.17 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  35.25 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  28.7 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.06 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  33.07 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  28.99 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  30.26 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.58 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.8 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  30.46 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>