More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2097 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 281 aa  557  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  76.81 
 
 		 282 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  54.02 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  52.04 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  51.15 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  50.77 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  51.87 
 
 		 272 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  51.32 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  48.46 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  48.11 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  49.04 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  47.66 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  46.24 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  48.64 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  48.64 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  48.64 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  45.59 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  46.47 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 270 aa  215  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  39.02 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  43.59 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  40.3 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  39.77 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.09 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.07 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  23.77 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  25.95 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  22.99 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.96 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  26.84 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  26.04 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.57 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.14 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  29.39 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.76 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  26.61 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.82 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>