More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0993 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2429  Exodeoxyribonuclease V  51.07 
 
 		 1148 aa  839    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.765298  hitchhiker  0.0020094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  43.2 
 
 		 1134 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  46.67 
 
 		 1109 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  100 
 
 		 1125 aa  2154    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  45.61 
 
 		 1110 aa  710    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  44.68 
 
 		 1094 aa  692    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  45.66 
 
 		 1132 aa  664    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  46.31 
 
 		 1115 aa  805    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3907  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  49.48 
 
 		 1139 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0574999  normal  0.0165259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  46.69 
 
 		 1115 aa  812    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  48.54 
 
 		 1111 aa  829    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  46.31 
 
 		 1115 aa  805    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  45.43 
 
 		 1097 aa  770    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.47 
 
 		 1085 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.71 
 
 		 1130 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.55 
 
 		 1129 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  32.03 
 
 		 1194 aa  340  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.39 
 
 		 1199 aa  340  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  35.68 
 
 		 1204 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.01 
 
 		 1207 aa  327  8.000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  31.12 
 
 		 1181 aa  326  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  32.29 
 
 		 1220 aa  324  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  32.29 
 
 		 1220 aa  324  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  32.29 
 
 		 1220 aa  324  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  31.3 
 
 		 1203 aa  323  9.000000000000001e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.87 
 
 		 1200 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  30.92 
 
 		 1212 aa  312  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  31.7 
 
 		 1183 aa  311  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  31.78 
 
 		 1180 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  30.22 
 
 		 1208 aa  305  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  31.89 
 
 		 1170 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.89 
 
 		 1168 aa  303  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  31.57 
 
 		 1180 aa  302  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.54 
 
 		 1241 aa  301  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  31.53 
 
 		 1180 aa  301  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.93 
 
 		 1221 aa  301  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.53 
 
 		 1180 aa  300  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  31.53 
 
 		 1180 aa  300  7e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  31.53 
 
 		 1180 aa  300  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  30.16 
 
 		 1224 aa  300  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  31.53 
 
 		 1180 aa  300  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1180 aa  300  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  31.15 
 
 		 1181 aa  298  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.76 
 
 		 1203 aa  297  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  31.04 
 
 		 1181 aa  297  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  31.04 
 
 		 1181 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.73 
 
 		 1226 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  30.94 
 
 		 1181 aa  295  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  30.83 
 
 		 1181 aa  294  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  32 
 
 		 1189 aa  294  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.26 
 
 		 1203 aa  294  8e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  31.06 
 
 		 1208 aa  293  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.22 
 
 		 1229 aa  291  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.42 
 
 		 1223 aa  290  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.39 
 
 		 1234 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.81 
 
 		 1259 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4568  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.77 
 
 		 1263 aa  285  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.75 
 
 		 1234 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.35 
 
 		 1203 aa  281  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.01 
 
 		 1200 aa  278  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.69 
 
 		 1236 aa  277  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  26.62 
 
 		 1265 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.16 
 
 		 1236 aa  273  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.72 
 
 		 1235 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.69 
 
 		 1251 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.37 
 
 		 1273 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.62 
 
 		 2007 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.19 
 
 		 1273 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.78 
 
 		 1226 aa  271  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  33.62 
 
 		 1235 aa  271  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.55 
 
 		 1232 aa  271  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.16 
 
 		 1273 aa  270  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.34 
 
 		 1240 aa  267  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.93 
 
 		 1273 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1273 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.33 
 
 		 1263 aa  264  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.95 
 
 		 1261 aa  263  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.26 
 
 		 1230 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.56 
 
 		 1251 aa  263  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  29.17 
 
 		 1274 aa  261  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.08 
 
 		 1238 aa  259  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.05 
 
 		 1269 aa  258  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.92 
 
 		 1216 aa  257  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  24.74 
 
 		 1261 aa  257  7e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.32 
 
 		 1274 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.2 
 
 		 1259 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.01 
 
 		 1269 aa  254  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.5 
 
 		 1270 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1390  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.15 
 
 		 1270 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1386  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.89 
 
 		 1263 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0472  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.5 
 
 		 1270 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.352906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1189  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.5 
 
 		 1270 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0680  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.5 
 
 		 1270 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1520  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.78 
 
 		 1934 aa  250  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.604792  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2851  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.28 
 
 		 1321 aa  249  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.38 
 
 		 1226 aa  248  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1757  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.4 
 
 		 1320 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.15 
 
 		 1226 aa  246  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.99 
 
 		 1276 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0546  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.32 
 
 		 1183 aa  244  9e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>