116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0674 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  52 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  52.63 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  57.97 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  47.5 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  52.7 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46.75 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  54.24 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  53.57 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  53.45 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  44.3 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  52.73 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  44.16 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  58.97 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  48 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  52.11 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  45.88 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  48.72 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  38.96 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  54.17 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  45.61 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  61.4 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  44.64 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  33.82 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  49.06 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  57.14 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  40.23 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  59.26 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  52.46 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  52.38 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  38.55 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  40.54 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  55 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09680  preprotein translocase, SecE subunit  39.47 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103622  hitchhiker  0.00000745581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  38.67 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  43.66 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  45.65 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  30.12 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  45.65 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3457  preprotein translocase subunit SecE  54.76 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  0.4312 
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  38.36 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  38.36 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  45.9 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  43.33 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.99 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  45.24 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  35.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  42.11 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  47.73 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  42.62 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  42.62 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3646  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.72376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  34.25 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  40.98 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  34.25 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.91 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.34 
 
 		 85 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 		 61 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  52.63 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>