71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0306 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  49.21 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.82 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  42.62 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  43.14 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  37.7 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  39.47 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  38.18 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  32.05 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  41.18 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  32.43 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.36 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  46.81 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  34 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  38 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  29.27 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0519  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  34.85 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  31.37 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 168 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  33.82 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2854  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.060593  normal  0.309086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  46.34 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.42 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0300  preprotein translocase subunit SecE  30.91 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  30.56 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  28.57 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3658  preprotein translocase subunit SecE  29.09 
 
 		 126 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000015215  hitchhiker  0.000000741444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  29.09 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  29.09 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  31.25 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 89 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 		 72 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  35.42 
 
 		 125 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  37.21 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  34.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  32.69 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  31.25 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3082  preprotein translocase subunit SecE  27.27 
 
 		 126 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000345525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>