96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1102 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 62 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  45.61 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  45.61 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  46.3 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0843  preprotein translocase, SecE subunit  44.07 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.481373 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  46.3 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.5 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  32.14 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  43.14 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  41.18 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  33.96 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  34.04 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  31.15 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  28.81 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.93 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1701  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0108119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  37.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  30.51 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  27.87 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.18 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  30.51 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  33.93 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 66 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 		 63 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 76 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 		 61 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3463  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000635394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3822  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0436537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3760  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000111945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1908  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286812  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3184  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000113463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3792  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000246891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2647  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00996997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0504  preprotein translocase subunit SecE  32 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  30.36 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  25.86 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.55 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0684  preprotein translocase, SecE subunit  27.78 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000000414413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 		 78 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>