77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1012 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  51.4 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  48.65 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  42.03 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  40.14 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  40.14 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  39.46 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  59.68 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  50.77 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  75.44 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  54.1 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  44.71 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  50 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  47.56 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 84 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  51.76 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  45.1 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  61.11 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  48.44 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  51.56 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  42.19 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  40.85 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  44.3 
 
 		 96 aa  62  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46.3 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  60.38 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  44.83 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  51.56 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  51.85 
 
 		 82 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  31.43 
 
 		 89 aa  51.2  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  44.3 
 
 		 93 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  51.06 
 
 		 60 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  43.64 
 
 		 72 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 98 aa  48.1  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 75 aa  47.8  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  41.27 
 
 		 66 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  38.03 
 
 		 78 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  34.12 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  45.59 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  34.12 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  47.83 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 60 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 81 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0385  preprotein translocase, SecE subunit  43.1 
 
 		 86 aa  45.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 77 aa  44.3  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 84 aa  44.3  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  46.94 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 96 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  32 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 73 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 74 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 80 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  39.13 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  53.49 
 
 		 60 aa  42  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 80 aa  41.2  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  28.71 
 
 		 129 aa  41.2  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  32.88 
 
 		 84 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 74 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 		 72 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 84 aa  40.8  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  29.69 
 
 		 120 aa  40.8  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 63 aa  41.2  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  53.66 
 
 		 63 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 74 aa  40.8  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 63 aa  40.8  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>