77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6642 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  47.69 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  60.98 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  55.95 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  36.65 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  41.46 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  43.33 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  43.33 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  49.4 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  36.09 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  45.16 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  56.45 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  51.61 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 89 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  45.35 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  48.81 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  43.68 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  40.24 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  44.05 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  65.45 
 
 		 210 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.5 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  40.87 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  35.21 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  50 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  43.16 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  35.82 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  50.94 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  41.89 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0385  preprotein translocase, SecE subunit  45.76 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  30.3 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  47.14 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  46.77 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  32.35 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  51.85 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  34.29 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  32.86 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  55 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  37.93 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  43.18 
 
 		 51 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.48 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  46.81 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  52.83 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  28.17 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  28.17 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  52 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 60 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  28 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  29.49 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4289  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573217  hitchhiker  0.00000222433 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  35.8 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  45.61 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 72 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0496  preprotein translocase, SecE subunit  31.82 
 
 		 127 aa  40  0.01  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>