34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0385 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0385  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 86 aa  168  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  48.28 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  46.55 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  43.1 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  42.37 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  43.1 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  28.24 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  35.19 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  36.21 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  47.37 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  31.71 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  35.96 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  31.37 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  28.07 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>