69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2348 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 80 aa  161  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  58.82 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  49.12 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  56.9 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0272  preprotein translocase subunit SecE  48.05 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000196165  hitchhiker  0.00824344 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0209  preprotein translocase subunit SecE  49.3 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000117834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  54.55 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  44.26 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.98 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  48.98 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  34.21 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  43.64 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  39.47 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  32.86 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  32.86 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  46.51 
 
 		 51 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.96 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  32.39 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  45.1 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  32.53 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  44.19 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  41.86 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  40.35 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  35.29 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  45.65 
 
 		 74 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 89 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  44.74 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.74 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  32.69 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 123 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 123 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>